Институт лазерной физики СО АН СССР был создан в 1991 году на базе Отделения лазерной физики (ОЛФ) Института теплофизики СО АН СССР и Отдела физики плазмы и космического моделирования (ОФПКМ) Института теоретической и прикладной механики СО АН СССР.
Первым директором Института был академик Вениамин Павлович Чеботаев. С 1992 года по 20.04.2016 директором Института был академик Сергей Николаевич Багаев (в настоящее время — научный руководитель). С 09.09.2016 по 22.04.2022 директором Института был чл.-корр. РАН Тайченачев Алексей Владимирович.
С 23.04.2022 приказом Министерства науки и высшего образования РФ исполняющим обязанности директора Института назначен д.ф.-м.н. Илдар Фаритович Шайхисламов.
С 27.08.2024 приказом Министерства науки и высшего образования РФ директором Института назначен д.ф.-м.н. Олег Николаевич Прудников.